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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点：可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

李家超：“通关”开局良好新一年期望拓展更多商机******

　　中新社香港2月1日电 (记者戴小橦)香港特区行政长官李家超2月1日出席香港中华总商会(中总)的春节团拜活动时表示，经历了三年疫情的挑战，香港在2023年迎来全面与内地和国际“通关”的良好开局。未来，特区政府会积极到香港以外访问，同工商界一起向外宣扬香港的营商优势，说好香港故事。

2月1日，香港中华总商会举行癸卯年春节团拜。图为香港特区行政长官李家超致辞。中新社记者陈永诺摄

　　李家超发表致辞时指出，香港与内地由今年1月8日开始逐步、有序、全面“通关”，方便工商界及不同人士更轻松地处理在香港和内地的不同业务，随着跨境人流恢复，香港与内地和国际间的合作将会日益频繁，大型的商贸展览、会议、体育盛事、不同赛事以及其他国际级的大型活动，都会陆续回到香港举行，充分展现香港作为亚洲盛事之都的角色。

　　李家超提到，中总在上个月组织了商务考察团，与特区政府商务及经济发展局局长丘应桦一起到越南，促进香港和当地的交流、联系和合作。他希望，中总未来继续为香港企业拓展更多、更广阔的商机。

　　另外，李家超表示，本月4日，他将会率领香港代表团启程前往沙特阿拉伯和阿联酋(阿拉伯联合酋长国)，展开他今年第一次外访，全力开拓香港和中东的发展空间，协助香港业界把握经济复苏的机遇，希望帮助中东企业进一步认识香港“背靠祖国、联通世界”的独特优势，让香港的专业服务在中东和更多“一带一路”国家发挥出来，开创更多互惠共赢的新篇章。

　　中总会长蔡冠深致辞时指出，“通关”为香港旅游业等带来曙光，防疫政策改变为香港经济注入动力，香港会继续做好投资者、营运者角色，全力把握“双循环”发展机遇。蔡冠深表示，中总会继续进行更多考察活动，继续组织商团出访各地，说好香港故事，不断为香港探索新的商机。(完)

　　（文图：赵筱尘巫邓炎）

[责编：天天中]

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